工作中遇到的抉择问题，希望各位集友不吝赐教

深圳工作，今年30。所在公司算是某个小众领域的行业第三，每年都有稳定的现金流和利润，且近年一直在增长。
老板喜欢投研发。我所在的项目便是老板3年前启动的，该项目与公司主营关联不大。我是跟着这个项目一同走过来的，从最开始只有我一个人开始做起。目前还未盈利。

现在情况是，公司在找投资。目前主营业务有被投资方看上。但是算上公司的很多预研性质的项目的话，利润就不太好看。所以公司准备将我所在的项目以及另外的预研项目分别建成分公司。我担任其中一个分公司的负责人。分公司以借款的形式向总公司要资金用于研发。
目前所知:老板和投资方是想让总公司主营业务上市。其他的预研项目老板是想打包成不同的公司，以便寻找其他的投资方进行投资。
我所在的项目个人认为技术上不成问题，目前是已快到开模阶段。

我想了解的是：我作为分公司的负责人，分公司从总公司处以借款形式获取资金。假设后续出什么问题。比如研发不顺利，总公司（包括投资方）想要分公司还钱的话，我需要承担什么责任？或者除此之外我还存在什么风险？
假设不是分公司，而是子公司，我是子公司法人，子公司从总公司处以借款形式获取资金，我又有什么风险呢？
从毕业就一直做研发，标准的程序员，不太懂这些，希望各位能够不吝赐教。
感谢。